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                    Massarray技术——中高通量大样本的SNP检测利器!


                      SNP(全称Single Nucleotide Polymorphisms)即单核苷酸多态性,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性,包括单个碱基的转换、颠换等。

                      SNP作为第三代遗传标记,分布非常广泛,在遗传分析,疾病诊治,分子育种和种群生态评估等诸多领域有十分重要的意义。

                      进行SNP检测的方法有很多,如直接测序法、taqman探针法、massarray法、芯片法、高分辨率熔解曲线法、KASP法等。

                      如果要对tens or hundreds的SNP位点在hundreds or thousands样本中进行检测,比如临床上指导用药相关SNP的检测(伴随诊断)、科研中对有限数量SNP的相关研究、潜在诊疗疾病相关SNP的大量样本验证等等,那么我们推荐你使用——massarray法!

                      massarray法是利用桌面式质谱仪来进行检测,具有检测成本低、周期短、灵活、实验操作和数据分析简单等特点,是中高通量靶点检测实验室的最佳选择。该技术目前已在全球范围内得到广泛应用,覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病等各个领域。

                      检测原理

                      massarray法基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(Matrix Assisted Laser Desorption /Ionization-Time of Flight, MALDI-TOF),该技术完美地整合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量和质谱技术的高精确度,是目前唯一应用质谱直接检测SNP的技术平台。

                    SNP检测原理


                      massarray法的优势

                      相对于其它SNP检测方法,massarray法的优势有很多:

                      1)靠谱准确

                      PCR+质谱,原理经典简单,仪器稳定灵敏,检测标的为质量变化,比基于碱基互补配对的探针杂交、基于溶解曲线的HRM检测标的更加绝对,原理更加坚实,结论更加可靠。

                      2)更灵敏

                      可以检测5%的SNP,够用?;赑CR+Sanger测序的检测方法难以达到。

                      3)对序列要求低

                      这点主要是与基于限制性内切酶的PCR-RFLP对比来的。

                      4)通量高

                      对比单次反应检测一个SNP位点的Sanger测序和ARMS-PCR、受限于荧光通道的探针杂交和ARMS-PCR,单管检测40个SNP的massarray通量够高。

                      5)速度快

                      单管检测仅需几秒。

                      6)性价比高

                      NGS当然可以检测SNP,但每个样本仅检测几十到上百的SNP位点,且样本量在百千数量级,从数据冗余、时间和金钱方面来看,NGS的性价比都太低!

                      7)更灵活

                      NGS必须凑够样本数量才能充分利用每次上机得到的数据量,从数据量角度,Massarray没有单次检测的最低样本数要求。

                      除此之外,massarray法也有一定的缺点:

                      1,需要特殊的仪器设备;

                      2,不能检测未知的突变;

                      3,每次检测样本和位点数有一定要求。

                      所以,massarray法适用于有相关仪器的实验室,或者大量样本同时进行多位点分型检测,如果你的实验室没有相关仪器,或者处理不了大量样本怎么办呢?

                      推荐——巴菲尔SNP检测服务

                      根据您对检测通量的不同需求,巴菲尔可提供高度准确和可重复的massarray系统技术服务,只需要您提供详细的SNP位点信息,巴菲尔生物将提供标准的实验流程报告及SNP实验结果分析报告,让您的实验全程无忧。

                      除此之外,巴菲尔生物还可提供直接测序法、taqman探针法等多种SNP检测检测方法,并且还可以根据您提供的待测位点信息、样本数量等推荐合适的方法进行检测。
                      巴菲尔拥有近10年的科研技术服务经历,在生物技术服务方面有着多年的经验积累和技术保障,大家可以完全放心,如果您有任何疑问,也欢迎您点击右边的在线咨询,专业的技术人员将随时为您提供解答。


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